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生理のしくみと不順
脳からの指令を受けた脳下垂体から、卵胞刺激ホルモンが分泌され、卵巣の中の卵胞が成熟、卵胞ホルモンが分泌されると子宮内膜は増殖し厚くなる。卵胞から卵子が排卵されると排卵後の卵胞から黄体ホルモンが分泌され、子宮内膜はさらに厚く柔らかくなり、卵子がつくやすくなる。卵子が受精せず、妊娠にいたらなかった場合、子宮内膜は子宮壁から剥がれ、出血と共に排出される。これが月経（生理）。
基礎体温は一周期の間に体温が低い時期（低温相）と高い時期（高温相）の２相に分かれる。この低温相から高温相に移るところで排卵がある。排卵が正常に行われていない場合は、高温相がなく、低温相が長く続くことになる。基礎体温をしっかりとつけることによってホルモンが正常に分泌されているかの目安を自分ではかることが出来る。